Sprawne zarządzanie magazynem zapewnia prawidłowy przebieg procesu logistycznego, który pozbawiony jest zakłóceń i opóźnień. Wymaga jednak przestrzegania pewnych zasad, a przede wszystkim sprawnej organizacji. W związku z tym przydatna okazuje się praca z oprogramowaniem dla logistyki. System pozwala zarządzać magazynem prawidłowo i wykorzystać jego pełną funkcjonalność. Dzięki jego stosowaniu możliwe jest odnalezienie dowolnej sztuki produktu, a także płynne zarządzanie długim łańcuchem zamówień. Tego typu działania należy rozpocząć jak najwcześniej, najlepiej gdy magazyn jest jeszcze pusty, ponieważ wraz ze wzrostem liczby produktów proces staje się coraz trudniejszy i czasochłonny.
Oprócz sprawnego oprogramowania ważne są działania osób zatrudnionych w magazynie. Pierwszym krokiem do sukcesu jest planowanie przestrzeni. Każdą wolną powierzchnię należy odpowiednio zagospodarować, by maksymalnie ją wykorzystać. Dodatkowo poszczególne obszary należy oznaczyć, by zapewnić płynność przemieszczania się po nim i ułatwić sprawne odszukiwanie towarów. Ważne jest również udrożnienie ciągów komunikacyjnych, by umożliwić poruszanie się wózkami widłowymi.
Równie istotna jest infrastruktura magazynu, czyli jego rozplanowanie i wyposażenie. Oprócz standardowych półek i wieszaków, należy zadbać o stanowiska administracyjne, czy przyjęcia towaru. Należy również wziąć pod uwagę procedury dostarczania i rozmieszczania dostaw, oznaczenia produktów oraz prawidłowe zarządzanie zapasami.